Traditioneel gezien zijn helpdesks vergelijkbaar met callcenters omdat ze beide een manier zijn voor klanten om ondersteuning of hulp te vragen bij een probleem. Callcenters verschillen echter van helpdesks en wel om een paar redenen. Callcenters zijn doorgaans minder technisch en behandelen algemene klantserviceverzoeken voor onder andere productvragen, het verwerken van retourzendingen en het vergemakkelijken van verkoop. Een tweede verschil met callcenters is dat klanten alleen telefonische ondersteuning van agenten kunnen krijgen.
Helpdesks bieden daarentegen meer technische of IT-gerelateerde ondersteuning. Ze helpen bij taken zoals het opnieuw instellen van wachtwoorden, het bestellen of configureren van nieuwe computerhardware, probleemoplossing voor technologie of het reageren op belangrijke netwerkproblemen. Naargelang het communicatieplatform en de helpdesksoftware waarvoor een onderneming kiest, kunnen klanten ondersteuning vragen via meerdere kanalen (telefoon, webchat, sms of e-mail) en zijn ze niet beperkt tot spraak, zoals in een callcenter.
Zowel helpdesks als callcenters zijn van grote waarde voor een organisatie. Ze zijn immers vaak het eerste contactpunt tussen een onderneming en zijn klanten. Ook kunnen ze het verschil maken tussen een positieve en negatieve klantervaring.